Группа параметров "Заказы магазина" модуля "1С инструменты" находятся в панели администратора по адресу Администрирование > Магазин > 1С инструменты > Настройки во вкладке "Заказы магазина".
Вкладка "Заказы магазина" включает в себя группу настроек "Заказы магазина из 1С":
При включенном чекбоксе "Игнорировать отмену из 1С", знаки отмены которые пришли на товар из 1С будут игнорироваться, этот функционал бывает нужен когда есть необходимость ставить отмены только в 1с-bitrix.